MRTGのグラフの大きさを変更する場合は mrtg.cfgファイルに を記載します。
上記設定では横600pixel 縦240pixelのグラフが表示されます。

MRTGは変更が必要なグラフの画像ファイルのみを更新するため、cfgファイルの変更後出力ディレクトリにあるグラフの画像ファイルを削除したのち、mrtgコマンドを実行しないと更新間隔の長いグラフのサイズは変更されません。